03/12-15   -   Pressemeddelelse

Ny teknologi sporer hurtigt nyt resistensgen

Et nyt resistensgen er fundet i colibakterier blandt grise, kyllingekød og mennesker i Kina. Bakterier med samme resistensgen er nu også fundet i Danmark, viser en ny dansk undersøgelse. DTU Fødevareinstituttet og Statens Serum Institut har meget hurtigt kunne skabe et overblik over situationen i Danmark, fordi mange bakterier har fået deres DNA-profil kortlagt ved hjælp af helgenomsekventering.

Et nyt resistensgen, mcr-1, er fundet i colibakterier blandt grise, kyllingekød og mennesker i Kina. Det rapporterede en videnskabelig artikel i det anerkendte tidskrift The Lancet den 18. november 2015.

Genet medfører resistens overfor colistin - antibiotika af typen polymyxin, der er den sidste mulighed for at behandle infektioner med multiresistente såkaldt gramnegative bakterier som fx E.coli- og klebsiellabakterier.

Teknologiplatform på DTU
Siden 2009 har DTU Fødevareinstituttet og DTU Systembiologi opbygget computerfaciliteter, som hurtigt kan kortlægge arveanlægget, DNA'et, i en bakterie og sammenligne resultaterne med fund af bakterier fra rundt omkring i verden. Mange bakteriefund i Danmark har fået deres DNA-profil kortlagt ved hjælp af helgenomsekventering.

Da resistensgenet, mcr-1, blev tilgængeligt for forskere den 23. november 2015, har DTU Fødevareinstituttet i samarbejde med Statens Serum Institut dermed meget hurtigt kunne skabe et overblik over situationen i Danmark til de danske myndigheder.

I modsætning til tidligere, hvor det var nødvendigt at udtage nye bakterieprøver, opsætte nye detektionsmetoder og udføre nye analyser, kan forskerne i dag få et overblik indenfor timer og dermed spare måneders arbejde.

Alle tidligere ca. 3.000 helgenomsekventerede gramnegative coli- og salmonellabakterier er undersøgt for tilstedeværelse af mcr-1. Resultatet viser, at mcr-1 er fundet hos én patient, som har haft en blodinfektion i 2015, og i fem importerede fødevarer i 2012-14. Alle bakterierne er multiresistente ESBL-bakterier, som også indeholder mcr-1 genet, hvilket yderligere kan komplicere behandling.

Globale databaser
DTU Fødevareinstituttet arbejder på at få oprettet globale databaser, som kan fremme intelligent brug af data fra helgenomsekventering.

Det sker blandt andet i netværket Global Microbial Identifier og EU-projektet COMPARE, som arbejder på at skabe et globalt system af databaser for helgenomsekventering. Databaserne skal anvendes til at identificere og diagnosticere sygdomsfremkaldende mikroorganismer og infektionssygdomme. De gør det også muligt at sammenligne data med information om udbrud og nye sygdomsfremkaldende mikroorganismer.

DTU Fødevareinstituttet varetager desuden rollen som WHO og EU referencelaboratorium for antibiotikaresistens. I den forbindelse planlægger referencelaboratoriet efter aftale med EU-kommissionen at undersøge forekomsten af mcr-1 i samarbejde med de nationale veterinær- og fødevarelaboratorier i EU.